Este armamento era usado generalmente en aguas libres de buques de guerra enemigo y con el fin de dar el golpe final contra mercantes alcanzados con torpedos, con lo cual se ahorraban los mismos cuya cantidad por submarino habia que cuidar para hacer mas efectivas y largas las misiones de patrulla. 

CAÑON 8.8 CM
Este cañon no era un tipo desarrollado a partir del famoso 8.8 cm usado como antitanque, mas bien estaba relacionado con el 8.8 cm Schiffskanone C/35, arma naval desarrollada y usada durante la I Guerra Mundial en los navios de la Marina Imperial Alemana. El cañon iba montado en un pedestal en la parte delantera de la torre de mando y contaba con un arco de tiro de 360 grados, con elevacion de -4 a + 30 grados. Disparaba un proyectil HE (alto explosivo) de 13.7 kgs con una velocidad inicial de 700 m/seg a una distancia maxima de 12.350 mts o un proyectil de 13.9 kgs con ojiva blindada; para navegar sumergido el anima del cañon era protegida por un tapon que iba insertado dentro del barril. 

El arma era manejada por tres hombres de la tripulacion (artillero, cargador y apuntador) con el soporte de otros miembros de la tripulacion que alimentaban el mismo a partir de las areas de carga de municion del submarino. En la cubierta, en la parte delantera y justo cerca a la recamara del cañon habia un pequeño deposito a prueba de agua donde se cargaba suficiente municion para el mismo con el fin de ponerlo en funcionamiento mientras de traia mas de los depositos interiores. En los laterales del mismo estaban instalados dos soportes en forma de U en los cuales se instalaban correas que soportaban al artillero y el cargador con el fin de evitar que fueran despedidos del submarino en combate. El uso del mismo estaba al mando del Segundo Oficial a bordo desde su puesto en la torre de mando.

CAÑON 10.5 CM
El cañon estandard de 10.5 cm usado el el Tipo IX en la primera mitad de la guerra era el 10.5 Schiffskanone C/32 instalado en el mismo tipo de pedestal usado para el 8.8 cm en el Tipo VII. Disparaba un proyectil de 23kgs a una distancia maxima de 15.300 mts o un proyectil de ojiva blinada o uno de 14.7 kgs. A medida que la guerra progresaba este tipo de armamento fue retirado y para 1943 la mayoria de los U-Boat Tipo VII no contaban con el, permaneciendo en algunos de los Tipo IX, la principal excepcion fueron los Tipo IXD2 en particular los que operaban en el Atlantico. 

2cm FLAK 
Los U-Boat usaron basicamente dos modelos de este cañon antiaereo Flak (Flugabwehrkanone), la version inicial 2cm Flak 30 era un arma de barril simple con giro de 360 grados y -2 a + 90 grados de elevacion. Disparaba un proyectil de 0.32 kgs con alcance de 12.350 mts, velocidad de tiro de 480 p/p/m, siendo su rango efectivo de la mitad del nominal. El segundo modelo del 2 cm mejorado Flak 38 contaba con una rata de fuego de 960 ppm siendo producido en version doble (Zwilling) y version cuadruple (Vierling); era un desarrollo directo de la version del ejercito y su unica caracteristrica adicional era ir instalado en un pedestal naval C/35.

3.7 CM FLAK
A partir de la segunda mitad de la guerra algunos U-Boat empezaron a ser armados con el 3.7 cm Flak M/42, arma del ejercito adapatada para uso naval, disparaba un proyectil de 0.73kgs a una distancia de 15.350 mts y una rata maxima de fuego de 50 ppm.

Dentro de las otras ramas transportadas en el submarino habia una pequeña cantidad de pistolas de 9mm o 7.62mm; subametralladoras de 9mm; ametralladoras de 9mm y rifles de 7.92 mm. Las ametralladoras de 7.92 mm eran usadas en ocasiones para aumentar el poder de fuego antiaereo de la nave.